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新型工具箱: 从MR生成CT图像,用于经颅超声刺激研究

2022-02-08 18:08
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2023年1月23日来自英国普利茅斯大学研究团队在Brain Stimulation杂志发表文章,发布了一个新颖的工具箱,用于从T1加权磁共振(MR)图像生成计算机断层扫描(CT)图像,用于规划人类的经颅超声刺激TUS)研究。

这个经过验证的开源工具箱允许使用现有的 T1 加权 MR 图像创建定制的头骨模型,用于 TUS 研究中的声学模拟,用于神经导航。该工具箱使用3D残差U-Net,在110个受试者上预先训练,并在37个单独的数据集上细化,从T100加权MR图像合成1 keV伪CT图像。该工具箱填补了现有方法的空白,有助于推广TUS的**实践和可重复性。该工具箱在MONAI中实现,MONAI是一个用于医学成像的开源深度学习框架。

关键要点

  • 该工具箱从 T1 加权磁共振 (MR) 图像生成计算机断层扫描 (CT) 图像,用于经颅超声刺激 (TUS) 研究。

  • 它旨在让研究人员为TUS研究中的声学模拟生成个性化的头骨模型。

  • CT 图像被认为是颅骨成像的黄金标准,但由于辐射暴露和 CT 扫描仪的使用受限,获取 CT 图像可能很困难。

  • 该工具箱使用预先训练的 3D 残差 U-Net 从 T1 加权 MR 图像合成伪 CT 图像。

  • 该网络在多个数据集上进行训练和验证,以提高其可推广性。

  • 经颅模拟的工具箱和随附代码是开源的,已被全球几位TUS研究人员使用。

  • 该工具箱旨在对新手和专家用户都很有用,可用于在他们自己的数据集上迁移学习应用程序。


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